等薛万彻和冯立带着两千精锐到达玄武门的时候，张公瑾正好把城门给关了。这样一来，薛万彻等人也只能围在玄武门外。
见这些人围着久久不退，李世民急了，当下就把李建成和李元吉枭首，把头颅扔下城门，意图借此涣散军心，好让这些人不战而退。
不过李世民是打错了算盘。一直以来，他都小看了李建成的人格魅力，这会儿，自然是不大不小吃了个亏。城门下边这数千人，见到李建成和李元吉的首级一首，非但没有军心涣散，反倒是叫喊这要给李建成和李元吉报仇。
刚才还只是围而不攻，这会儿这些人拼了命开始攻打起城门。一时之间让李世民这边尽管是占据着城门之利，还是损失惨重。
见玄武门这个时候久攻不下，薛万彻和冯立在斩杀了云麾将军敬君弘以后，叫嚷着要去攻打秦王府。这一下子可是把李世民给逼急了。秦王府虽然有着段志玄带领基本上所有的秦王府亲卫在守卫，但是现在看这个样子，明显那些人根本就抵挡不住。
李世民忍不住就要开城门和薛万彻这些人血拼了。
正在这个时候，尉迟恭带着李渊的圣旨到了。这下可就好办了，组织起皇宫中的千牛卫，李世民手里头也算是有了一些底气，当即就打开玄武门，准备和薛万彻打一场。
这城门也打开了，薛万彻也留住了。本来薛万彻看李世民手底下虽然将领众多，但是兵力不足，还想这借此机会为李建成报仇呢，谁知道这个时候李世民就把千牛卫给收拢过来了。这不，短兵交接，开始了死战。
可是仅仅是不到半刻的时间，局势发生了很大的变化。
高士廉这个时候终于搞定了长安城内大狱中的死囚。这会儿正好赶了过来，虽说拉起来的这些人没有经过正规的军事训练，这会儿就是阵形都能一点也没有，但是从远处望去，黑压压一片，人数绝对不少。
这个时候薛万彻和冯立两个人见大势已去，只能决定逃跑。
对着还在苦战的士卒们说道：“我等杀了敬君弘，也算是可以略微的报答太子殿下了，诸位，还是散了吧。”当下就带着亲卫们杀出重围，往终南山方向逃离。李世民派出去一队人马，可是怎么也追不到，只好作罢。
见主将已经突围出去，剩下的这些士卒，也军心涣散，无力抵抗，只能就此投降。看着场上已经再也没有反抗的力量，李世民这才让人把这些士卒看押起来。
有了手上的圣旨，李世民调动兵马就很是方便了。京城中这个时候的兵马，并不适合全都出动，越是这个时候，越要把这些人安抚好了。所以李世民下令，除非是得到他的手谕，任何人不得私自调动部队。
安下心来，李世民就要处理东宫和齐王府的事务。