幽域组织改组成为蜂巢式的十级结构：
0级权限，代号“蜂蛹”（考察中的待吸纳人员）
1级权限，代号“野蜂”（未进行解封仪式的外围成员）
2级权限，代号“工蜂”（经过考察后加入幽域组织的基础成员）
3级权限，代号“雄蜂”（后勤人员）
4级权限，代号“兵蜂”（战斗人员）
5级权限，代号“头目”（超限小队队长）
6级权限，代号“首领”（超限战队队长）
7级权限，代号“分巢蜂王”（区域性的低层管理人员）
8级权限，代号“蜂王”（分基地的中层管理人员）
9级权限，代号“蜂皇”（主基地的高层管理人员）
有了这十级结构，就可以通过成员对组织做出的贡献，进行一定程度的奖励和权限下放，更有利于组织的管理。