所以到后来，举凡武职世官、流官、土官之袭替、优养、优给之类的事务，皆由所属都司卫所上报于都督府，都督府再转送兵部请选。选定后，经由都督府下达都司卫所。如此一来，都督府就变成了一个传话的机构，实权几乎没有，自然也无法有效节制各地都司卫所。
而兵部呢，又没有直接管辖各都司卫所的权力，最后的结果，显然就造成了两不管的局面。
其实田从焘对这种类似于府兵制的制度，并不太看好。首先管理难度大，容易滋生弊病；其次战斗力低，军心涣散，难以产出军事人才。世袭制限定了军士们的身份，没有上升空间，太平年代，只能苦哈哈的受上官奴役，不太平了，又被推出去当炮灰，换了他也要逃跑。
可惜他只是奉旨整顿卫所，并不是要废除卫所，所以只能在现有基础上，想一些改进措施。所以他请来了秦远。
秦远答应帮忙之后，没多久就提供了一份整改措施，这份整改建议很全面，但终归只能治标，难以治本，所以田从焘拿到之后，只说要好好看看，并没有递上去给田惟彰看。
可是在把卫所查了个底朝天之后的现在，田从焘又不得不承认，秦远的这份方案实在算得上是面面俱到、老成持重，是个不伤筋动骨，还能达到一些目的的好方案。
就在他犹豫的时候，东都来了消息：元庆三年十一月，田惟彰下旨册封第四子田从熙为太子，并定于十二月二十日行册封礼。命各宗室藩王、两京五品以上官员皆到场观礼。
田从焘出发之前，又跟秦远碰了几面，将整改措施细细修改完善，然后就让人快马加鞭先行呈送给田惟彰御览。
这样一来，在田从焘到东都之前，田惟彰已经有足够多的时间来研究这份整改方案，等他到了之后，也能尽快将此事讨论出个结果。
田惟彰等这个整改方案已经等了很久，所以一收到就先仔细研读了一番，还把顾名俊找来，让他一同参详。
“秦尚书真是宝刀未老。”顾名俊看完之后，先赞了一声。
田惟彰一笑，问道：“爱卿觉得可行？”
顾名俊恭恭敬敬的回道：“秦尚书曾两度将兵，对地方都司卫所知之甚深，此番所提诸事都切中利害，臣甚为佩服。只是这任免、升调、训练之权回归五军都督府，恐让兵部失了节制之权……”
“爱卿与秦远可有私交？”田惟彰不置可否，忽然问了一个不相干的问题。
顾名俊心中一紧，面色却不变，答道：“回陛下，臣多年来一直在京为官，秦尚书却多为外官，因此臣与秦尚书并无私交。”
“是么？朕怎么记得，当初秦远被人弹劾的时候，卿曾为他说话？”
顾名俊微微躬身：“陛下明鉴，臣虽与