本着不枉不纵的精神，审出一个捉一个，捉回来再审，审了再捉。从十二月十一到十五日，一共捉了五天，监狱中就满满地关了上万人，金陵城内的明遗几乎一扫而空，万磊这才收手。
捉人的同时，精忠卫也在积极地“罗织”证据，把这上万人分成主谋从犯胁从犯和知情不报者，而案情也直接对外公布，接受官民监督。随着对舆论的刻意引导，很快，金陵城人人都在热议炮击案，大部分人都是对案犯破口大骂，特别是对以朱允炆为首的宗室，百姓都骂他们背信弃义，几乎没有同情他们的。
证据罗织完，下一步就是移交法院审判，不过由于朱允炆朱橞耿炳文方孝孺等人的地位特殊，不必走正常的审判程序，而是由万磊直接下总统令批示处理。
十二月二十，万磊下达一个总统令，宣bù
原有的皇室优待条例作废，宫廷内所有宗室人员和宫女全部出宫，宫中只留下少数太监负责打理，宫城封闭，划为故宫博物院。
被扫地出宫，建文帝的老婆儿子们就成了无家可归的人，还有那些原本当惯了主子的亲王公主们也无比凄凉，处境比那些宫女还惨，因为那些宫女好歹还能自食其力，而且出宫的时候每人还能拿到二十银元的遣散费。
十二月二十一，万磊让人把朱允炆从特别监狱中带出来。由于被关了几天，朱允炆的面容憔悴，不复养尊处优的富贵样。不过，他倒也硬气，死也不肯向万磊低头，甚至反过身去，连看都不看万磊一眼。
对于这种死不悔改的顽固分子，万磊是有办法的，他叫精忠卫把朱橞也带上来。而朱橞却是个十足的软蛋，吃了几天牢饭，就倒豆子一般把所有同犯都抖了出来，就连朱允炆也不能幸免。
“朱橞，你好大的胆子啊，居然敢行刺我！”一见面，万磊就厉声喝斥。
“大总统陛下，我，不，小的只是奉了他的命令，才，才一时糊涂。”朱橞一指站在与旁的朱允炆，非常不地道地把这个侄子给出卖了。
“我不管你是不是主谋，反正你是主要实施者，按照大华民国刑法，行刺大总统，以叛国罪论处，主谋者与实施者皆要叛处死刑立即执行。”万磊正色道。
“啊！”朱橞听到死字，不由得一声惊呼，吓得脸都白了，忙跪趴在地上，磕头道：“大总统陛下，小的只是一时糊涂，还请陛下法外开恩。”
“一时糊涂？不见得吧。”万磊怒目直视，“你们这叫死不悔改，留你的性命，说不定还会对我进行下一次暗杀，你以为我会养虎贻患？”
“陛下，小，小的以后再也不敢了，还请陛下放过小的吧。”朱橞哀求道，眼泪都快下来了。不过这也不能怪他，杀头掉脑袋谁不怕啊。
“口头保证没有用，要有实jì