杭州济仁药厂还未正式开工，但当时的中医界，却正面临着一场暴风骤雨。
1929年2月，南京国民政/府卫生部，召开了成立后的第一届中央卫生委员会会议，决定卫生事业发展的一些核心问题。
史料记载，与会成员共14人，除个别医事领域的行政官员之外，均为当时国内医界名流，如褚民谊、颜福庆、武连德等。
会议讨论了由西医余岩等人提交的《废止旧医以扫除医事卫生障碍案》，其核心观点为：中医所秉持的阴阳五行经络等学说，皆为穿凿附会，凭空杜撰，缺乏实验科学依据；
中医临床所使用的望闻问切等诊断手段，与“巫术”及“迷信”类同；
中医所使用的药物缺乏科学检验，不足凭信；
作为个体的中医，在调查死因、勘定病类及预防疾病等公共卫生领域，毫无作为；
结论是：“旧医（中医）一日不除，民众思想一日不变，新医（西医）事业一日不上，卫生行政事业一日不能进展。为民族进化计，为民生改善计，不可不采取断然措施。”
余岩等人的建议办法是：施行旧医登记，给予执照方能营业，登记限期为一年；
限五年为期训练旧医，训练终结后，给以证书，无此项证书者停止营业；
自1929年为止，旧医满50岁以上、在国内营业20年以上者，得免受补充教育，给特种营业执照，但不准诊治法定传染病及发给死亡诊断书等。
此项特种营业执照有效期为15年，期满即不能使用；禁止登报介绍旧医；检查新闻杂志，禁止非科学医学宣传；禁止成立旧医学校……
余岩等人的提案获得了通过，正式定名为《规定旧医登记案原则》，并被写入当年2月25日的会议记录。
这还不算，与此同时，余岩等另拟《请明令废止旧医学校案》呈教育部。
这就是轰动一时的“废止中医案”。
或许是考虑到余的提案过于激进，会议最后通过的废止中医案中采取的办法明显和缓了许多……
但议案仍规定了废止中医的三条原则：
“甲：旧医登记限至民国十九年（1930年）为止；乙：禁止旧医学校；丙：其余如取缔新闻杂志等非科学旧医之宣传品及登报介绍旧医等事由，卫生部尽力相机进行。”
该消息由上海《新闻报》率先公之于众，立即遭到了上海中医界的强烈反对，也引起社会各界的强烈反响。
1929年3月17日，全国医药代表大会在上海开幕，共有15个省131个团体的262名代表出席会议。
同日，上海市内的各中药铺停业半天，反对废止中医药决议案，并提出惩戒提案人