千头万绪，李从燕无奈之余只能等到新军整编完毕之后，再酌情让几人回归行伍。
至于刺史府的各部参军之职，李从燕决定各项事务步入正轨后增加人手，从登州一城四县现有的官吏中择优提拔，同时还要广招贤才。
此后一段时间，在司马李魏和司兵参军徐晖的整顿下，两百名牙兵最先到位，开始在登州城内的校场集结整训。
而登州本地的兵马也被搅动起来，十五天的时间里，司兵参军徐晖经过三轮选拔，从登州一城四县挑选出五百多名可用士兵，用时三天才全部集结到登州城内校场。如此加上两百名牙兵，一团兵力终于凑齐。
李从燕随即一头扎进校场内，开始亲自督促这一团士兵整训，这些支兵马将是自己起家的本钱，自然颇为看重。
虽然登州军备废弛，可是自大唐以来华夏尚武之风浓厚，军队的操练之法非常完善，所以李从燕也没有什么可操心的，依照现有的操典按部就班实施就好，这些事情李任、李魏等家将都熟念于心。
只是李从燕对于操练质量严抓不放，还特意命人赶制了大量的沙袋绑腿、单杠等器械，然后以后世“红色军队”的严苛训练为蓝本，加入队列、负重长跑、俯卧撑、野外生存等“私货”，几乎是压榨一般锤炼这些士兵的体能。
同时李从燕还大力推行暗号制度，加强新军的保密意识。在训练之中，李从燕让新军士兵在进行齐步走、跑步等训练时，要喊着“一二一”，下级将士向上级将领禀报事务要喊“报告”。将来李从燕还准备在军中推行内务制度、设置类似于政~委的辅助军官等等，不过这些都是后话了。
此外李从燕还在现有军律的基础上，补充了一些新的规定，例如：军中不准赌博、不准饮酒、不准劫掠百姓、严格卫生条例、军官不得体罚士兵等等。
李从燕专门命人将新增加的军律、以及原军律中合理的部分整理成册，编撰成《新军要纪》，然后全军分发下去。
在李从燕的督促下，新军将士每火分得一本《新军要纪》，由识字之人负责每日诵读，旅帅以上将领更是人手一本。
李从燕严令：全军上下必须在十五日之内，将《新军要纪》背诵熟练。十五日后全军进行大检查，凡是背诵不过关者，士兵当众杖责二十，各级将领当众杖责三十，而后再给五日温习背诵，如再不过关，不论士兵还是军官，一律驱逐出营。
起初新军士兵对于这本《新军要纪》非常抵触，认为自己不过是武夫而已，赌博、饮酒都是寻常事，为何要禁止？又为何要一字不落的背下来？平日里新军的操练已经非常辛苦了，还要没日没夜的背诵军律，还要不要人活了！
没过两天，便有几名登州兵马出身的新军士兵带头闹事，鼓动起数十