令外一个让南云感到犹豫的原因是他手上的机动舰队的实力受到了削弱，日本海军最强的第5航空战队的“瑞鹤号”航空母舰在新加坡樟宜海军基地因受到轴心国轰炸机的轰炸受了点轻伤，但并不妨碍作战。但海军军令部却下令把第5航空舰队调回本土进行维修，这极大地削弱了南云手中的航空力量。
7月7日凌晨3点20分，南云中将的旗舰“赤城号”上的扩音器宣布执行空袭任务的飞行员准备出动。航母飞行甲板上的地勤人员已经开始作着飞行着的准备，飞机的发动机开动起来，响起了震耳欲聋的马达轰鸣声。
现在南云需要作出决断，是首先攻击敌人的登陆舰队还是进攻为登陆船队护航的舰队？轴心国的登陆部队从昨天下午开始从明古鲁进行登陆，只有一个大队担任守备任务的日本陆军一直在不停地请求增援。到了晚上，陆军的通讯已经中断，再也没有收到什么消息，估计这个大队已经全体“玉碎”。
现在航空队就要起飞进行攻击了，而南云海军中将对敌舰队的动向仍然一无所知。敌人有一支登陆舰队，另外还有一支护航舰队，但不清楚对方身后是否还有一支增援舰队。他对敌情作出了错误的判断：敌人目前还没有觉察自己的企图，也没有发现机动部队已经出动。
因此，南云决定先对轴心国的登陆舰队进行空袭，支援陆军的反击行动，然后再全力对付护航的轴心国舰队。
这个决定最终葬送了日本海军机动部队所有主力。
7月7日，这是一个很特别的日子，正好是日本发动全面侵华战争四周年的纪念日。在拂晓前的黑暗中，在距恩加诺岛东南大约40海里的水域，第一攻击波正在准备从南云部队的航空母舰上起飞去空袭在明古鲁进行登陆的轴心国船队。
凌晨4点30分，虽然天空中有大片的阴云，但东南风和平静的海面为飞机起飞提供了理想的条件。东边的天空微微发白，水天线隐约可见。离日出还有大约四十分钟，日本机动部队包括“赤城号”、“加贺号”、“飞龙号”、“苍龙号”和“祥凤号”在内的五艘航空母舰开始作迎风转向，飞机的引擎起动了，从飞机的排气管里喷出青白色的燃气。飞行甲板上，一片震耳欲聋的嘈音。
为首的一架“零式”战斗机加足马力，在“赤城号”甲板舰员的欢呼中从航母上起飞了。随着一阵阵发动机的轰鸣，一架架战机接连不断升上了漆黑的天空，随后十八架俯冲轰炸机也很快地全部升空。日本舰队的上空，红蓝灯整齐地排列着，表明那些“零式”战斗机已经编好了队形。
4点55分，完成编队的首批一百零八架飞机在完成编队后向西北方向的天际飞去。
与此同时，担任吸引敌人进攻任务的威尔赫姆?马绍尔海军上将也