副本挑战是《苍穹之巅》的重要组成部分之一，游戏中的副本共有八种，分别为每日副本；每周副本；每月副本；岁末副本；名将副本；秘密副本和最后的传承副本。
每日副本：每个玩家每天可以进入三次，副本会奖励永久增加外功；内功；心法；身法；四大属性值的药物，也会爆初级的武器和武学书，还会爆进入每周副本的入场凭证。
每周副本：每个玩家每周可进入三次，每次进入都需要周副本入场凭证一张，副本内会奖励初级或中级武学书，还会奖励初级~中级的武器，还有每月副本的入场凭证。
每月副本：每个玩家每个月可进入一次，每次进入需要一张月副本入场凭证，每月副本会爆中~高级武学书，属性药，其中还包括增加真气值的属性药，还会爆中级到高级的武器。
岁末副本：每年的年底游戏都会开启岁末副本，而进入岁末副本当然也是有条件的，玩家必须通关1~12月的所有月副本才有资格进入。
岁末副本会爆高级武学书和武器，有一定几率爆顶级武学书和精铁级别的武器，还有一定几率爆特殊道具和唯一坐骑，当然也包括属性药。
以上副本都有三个难度和两种模式，三个难度分别是简单；普通和困难，难度越高，爆率就越高。
两种模式是个人模式和团队模式，模式虽然不同，但爆率都是相同的。
而副本的难度也是根据玩家成功挑战的次数来增加的，比如你刚刚进入游戏，第一次挑战每日副本，那么这一次可以说是最简单的。
第一次成功后，到了第二次难度就会提高，你挑战成功的次数越多，下一次挑战的难度就越高。
以上四个副本都很难，但还不是最难的，最难的副本上接下来的三个副本。
名将副本：该副本是游戏公司以各个国家古代历史名人为蓝本制作的特殊副本，名将副本中会爆出具备成长性的唯一武器。
名将副本很难，非常的难！
进入名将副本的玩家都会受到名将的诅咒，名将的诅咒就是各种负面的BUFF，除了这些以外，名将副本是有时间限制的，限时15分钟，过了时间就算你没死也算失败，不但如此，名将副本是没有团队模式的，必须单人通关才行。
也就是说，想要挑战名将副本，想要获得独一无二的成长性武器不是你有钱有一身好装备有一堆牛X武学，手底下有一大堆小弟就行了，你要有的是卓越的单人作战能力。
名将副本的开启是有时限的，或许是开启三天，或许会开启十五天，时间由系统来定，这段时间内，谁通关的速度最快谁就能获得唯一成长性的武器，如果没有人能通关，那么本次名将副本就算是挑战失败了，所有人也只能等下次