蒙古军事制度的影响，用编组蒙古千户的形式编组侍卫亲军，有功之臣可以自己征集下属并实施管理。
但是由于侍卫亲军中编入了大量的汉军，难以如蒙古等游牧民族一样的生存方式，需要大量的粮草补给和挣钱养家，所以需要‘养’，朝廷便制定了相关政策发放军饷，还有临时补贴、战时津贴和战功奖励。比如“出差”，像押运饷银、抓捕逃犯之类的，都算“出差”，就有的补贴，官兵有红白喜事也有国家补助，战时津贴则包括开拔前后给的行装费、盐菜口粮等杂项，打仗的时候，士兵的收入可以达到平时收入的数倍左右。
这一切在玉昔帖木儿来看，朝廷的整个行为逻辑从根本上讲，其实并没有把侍卫亲军当‘兵’来养，而是当做‘看家狗’看待，平时喂剩饭，战时扔骨头，再对奸淫掳掠睁一只眼闭一只眼，就能对付天下的‘乱民’了，至于说国防，那是不必考虑的，反正天朝有一副庞然巨兽的大架子，一般人还真不敢挑战它。而国家也不会掏钱白养着，那么就让他们屯田实现自给，以便废物利用。
而玉昔帖木儿却看得很清，，任何一个政治集团都存在内部的分层，上层贵族由于拥有诸多政治、经济特权可以有效变现。侍卫亲军中同样如此，作为统治阶层的蒙古人和特权阶层的色目人可以恣意妄为，夺占屯田、侵占公产，奴役手下的官兵。而侍卫亲军的底层汉军官兵，在朝廷军户制的约束下无力脱身，在上层的剥削下日渐贫困。
都说‘学好一辈子，学坏只需三天’，蒙古人在大规模战争结束后，走向安定后，迅速腐化堕落，克扣军饷、喝兵血这些把戏可以说是无师自通，此外还有‘国家认可’的合法克扣等手段。他们可以养马为名，要求全体官兵‘众筹’，每月按照额定数目扣除。这项银两存储营中，以备买马之用。买补马匹余剩款项，年终报兵部核明，送户部充饷。
另外按照当时的历法，岁有闰月，也就是说有时一年会有十三个月的现象出现，那么就要多发一个月的军饷，可朝廷觉得这样按月发工资就亏了，于是便让让军官和士兵拿出自己的工资来“买保险”……换句话说，国家无论一年几个月，只发事儿个月工资……这真不是一般的教条和“节俭”了。
如果这些算是‘合法’的国家克扣，侍卫亲军的官兵还要面临各级将领们的克扣，这部分就是违法的，可也最是根深蒂固的，办法还很多。比如在将领在本部队放债，直接扣发军饷还本付息，还有假冒填补军械而扣士兵工资来尽义务，还有各种迎来送往和办公费用摊派到士兵军饷里克扣，这种手法可谓与彼时的大宋如出一辙。
此外还有更奇葩的方法。当兵就要搞军事训练，这是谁都知道的，而这部分钱也是应当由国家支付的。但是军官们却要将日常训练中所耗费的箭矢钱，