然而一个名叫林楚的叛徒，向殖民当局告了密。殖民者便以明人准备进攻巴城为由，发动了大规模的屠杀。
殖民者以搜查军火为名，命令城内明人交出一切利器，荷军挨户搜捕明人，不论男女老幼，捉到便杀，对明人进行血腥洗劫。
屠杀持续7天，城内明人被杀近万人，侥幸逃出者仅150人，被焚毁和劫掠的明人房屋达六、七百家，财产损失，无法估计。
城外明人在黄班指挥下，与荷军激战，伤亡千余人，后转战中爪哇，黄班的部队因武器太差，攻城7日不下，撤退。
这就是当时震惊爪哇、华夏和欧洲的巴城大屠杀，“红溪惨案”
在荷兰殖民者退出后，土著对明人的屠杀更加肆无忌惮。
几乎造成50万大明子民被屠杀，五千多起大明妇女被强bao。
历史上那些惨案历历在目，朱由检既然穿越在大明，他绝不可能让这些血淋淋的惨案有机会发生。
蒸汽小火车转了几圈之后，朱由检挥手叫停：
“蒸汽小火车已经没有什么问题，工部准备开始修建铁路吧，争取两年之内，让各个大城市之间铁路贯通，户部要拨专款支持。”
“微臣遵旨。”
工部尚书和户部尚书急忙躬身领旨，他们知道以现在大明工部的实力和户部的财力，修建铁炉并困难。
交代工部和户部之后，朱由检回头看看身后一众文武大臣说道：
“现在所有文武官员，特别是兵部五吴军都督府的官员，马上赶回去上朝，朕有很很重要的事情要和群臣商量。”
群臣这才发现皇上的脸色突然变的很严肃，大伙心里都不禁紧紧揪了起来，他们都知道，一旦皇上脸色不好看，肯定又要有人倒霉。
“遵旨”
随着上朝的钟声响起，满朝文武齐聚皇极殿，没有一个官员敢迟到或者不到，京师反击战后，皇极殿的掌声很少响起，群臣都知道有大事发生。
朱由检四平八稳坐在龙旗之上，群臣急忙上前躬身参见：
“参见陛下。”
朱由检大手微抬：
“诸位爱卿，免礼平身。”
“谢陛下隆恩，吾皇万岁万万岁。”
群臣谢恩后，朱由检目光在大殿中扫视一周，随后问道：
“兵部，现在大明西南，西北，辽东和漠南情况如何？”
兵部尚书孙承忠急忙上前施礼：
“回禀陛下，据黔国公沐天波上书，西南暂时还算平静，虽然安南和东吁偶尔有些小动作，但并不敢直接侵犯大明边境。
西北方向没有任何问题，李岩已经把那里治理的仅仅有条，如果有人胆敢侵犯西北地